刚开始角膜需要用抗病毒药物治疗。细菌性角膜炎，需要清除大量分泌物，根据细菌类型用抗菌药物治疗。霉菌性角膜炎，需要用刀片或者是锐器，将角膜表面的霉菌感染部位刮除，然后应用抗霉菌药物治疗。
要是自体免疫性角膜炎，需要用羊膜移植遮盖，用免疫抑制剂治疗。
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