食管蹼可能是由胚胎期内食管发育过程中形成空泡，空泡融合不全，遗留下部分或完全的黏膜环状膈膜;也有人认为是在食管发育过程中，取代绒毛柱状细胞的鳞状上皮过度生长所致。
食管肌环是因胚胎期的食管肌层形成过程中，中胚叶成分过度增生而造成食管狭窄。
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