发烧40度，检查血支源体感染。

您好，根据您所提供的情况目前伴有支原体感染的存在，可导致发热的出现，同时可伴有其他症状，如咳嗽，咽痛等，如果病原体没有去除，发热可反复出现。

目前考虑疗程不足，应该继续用药。建议您平时注意孩子保暖，避免着凉，多饮水，多休息，定时检查体温情况，体温升高超过38.5度可口服对乙酰氨基酚使体温恢复正常，同时继续应用上述药物治疗，疗程要足。