慢性直肠炎其病因可为细菌、霉菌、病毒、原虫等微生物感染，亦可为过敏、变态反应等原因所致。慢性直肠炎分为两种：直肠粘膜及其下层肥厚者，为慢性肥大性直肠炎；
如直肠内的肠腺及其间质萎缩改变者，称为慢性萎缩性直肠炎。
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