肛瘘术后的检查有直肠指诊，或用探针探查。如果这些检查没有查明原因，还可以做影像学的检查，比如B超、CT、核磁。通过B超，可以找到隐藏的高位脓腔或者瘘管。
除此之外，如果想进行更准确的检查，也可以做局部的CT或者核磁，也能发现隐藏的瘘管、脓肿。
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