宝宝21日被诊断疱疹性咽峡炎发烧39.8并有衣原体

问题分析：你好，宝宝上呼吸道感染病毒出现咽峡炎，抗病毒治疗3天左右即可，支原体感染一般需要治疗2到5天，宝宝退热后再次发热考虑继发性菌感染的可能，可进行头孢治疗。

意见建议：建议您就诊儿科住院治疗，做相关检查，明确细菌感染的种类，选择敏感药物治疗，积极控制体温，避免高热持续。