可以对颅脑与脊髓MRI对脑肿瘤、脑炎性病变、脑白质病变、脑梗塞、脑先天性异常等进行诊断。可发现早期病变，定位也更加准确。
对颅底及脑干的病变因无伪影可显示得更清楚。MRI可不用造影剂显示脑血管，发现有无动脉瘤和动静脉畸形。
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