引起唇裂的发病因素可能分为遗传因素及环境因素两个方面，并与营养、遗传、感染、内分泌等因素有关。唇裂的患者可发现在其直糸亲属或旁糸亲属中也有类似的畸形发生，因而认为唇裂畸形与遗传有一定的关糸。
遗传学研究还认为唇裂属于多基因遗传性疾病。
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