角膜炎的治疗要根据病因治疗，明确引起角膜炎的原因。要进行角膜溃疡的刮片，甚至再培养，也可以在显微镜下染色观察是否有真菌的菌丝等。
还可以进行药敏试验，确诊引起角膜炎的病因。明确病因以后，可以进行有针对性的抗细菌、抗真菌治疗。
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