医院设置有国家重点学科全军结核研究所、全军器官移植中心等 48个专业学科。与总医院相关科室联合,先后成立了消化病中心、肾脏病中心、血液病中心、心血管病中心、神经疾病中心、麻醉手术中心、内分泌代谢疾病中心、传统医学中心和口腔医学中心、国际肿瘤治疗中心。
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