可能是遗传因素：父母为唇腭裂，其子女的发病率比正常人较高；营养因素：母亲怀孕期间营养缺乏，如维生素、叶酸、微量元素缺乏；
内分泌因素：怀孕期间过于紧张，或其它原因导致应激状态，易导致唇腭裂发生；其它因素：包括使用药物，如解热镇痛药、水杨酸类药，可导致唇腭裂发生。
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