肠道菌群失调的治疗主要是服用一些活菌类药物，但是能否达到调整肠道菌群的目的，还要看具体情况，并不是服药之后就能改善的。
所以用药时间不好确定，但至少是数周以上。你说的乳酸菌饮料主要是含有一些可以分解乳饮成分的活性菌，对肠道菌群失调是没有治疗作用的。
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