冷冻胚胎移植主要是根据移植当月排卵情况和子宫内膜情况来定移植时间的，一般也是在月经的中期。对于月经正常、有自发排卵的人，会在月经中期监测排卵，确定自然排卵时间后，根据冷冻胚胎时的培养天数确定移植时间；
月经稀发或月经不规律者，可以用人工周期准备子宫内膜。
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