我女儿今年16岁，今天早上感觉头疼低热颈部疼腿也酸

问题分析：根据您的描述头疼颈部疼腿疼，这些症状显示全身症状，若平时身体不错，无基础疾病，不像脑炎的症状，感冒也可以出现上述症状。

意见建议：脑炎（森林脑炎），森林脑炎又称苏联春夏脑炎或称远东脑炎，是由森林脑炎病毒经硬蜱媒介所致自然疫源性急性中枢神经系统传染病。

临床特征是突然高热、意识障碍，头痛、颈强、上肢与颈部及肩胛肌瘫痪，后遗症多见 您的怀疑应该不正确