胚胎停止发育的原因有很多种，孕早期胚胎停止发育的原因主要有胚胎染色体异常、黄体功能不全、甲状腺功能减退、免疫系统异常等。
孕中期胚胎停止发育的原因主要有：子宫解剖结构的异常、免疫系统异常以及血栓前状态等等，需要引产的。
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