前列腺真菌感染常为全身性感染的一部分,所以治疗应该包括全身及局部治疗。多种抗真菌性药物可以选择应用,全身应用广谱抗真菌药物可以选择两性霉素B、氟康唑、酮康唑或咪康唑等,连续治疗一个月以上,一般需要治疗2~3个月,应该注意抗真菌药物的副作用。
应用小苏打等药物碱化尿液,不利于真菌的生长,也有一定的治疗作用。皮下注射使用含有白色念珠菌孢子体的特制菌苗,可以特异性的增强机体对该病原体的免疫排斥作用。
鸟岛内灌注龙胆紫可以直接杀灭局部的病原体。
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