有胎心、胎芽的病人也有胎停的风险。目前胚胎停育的因素较多，有单因素也有多因素。早期发生胚胎停育有一半跟染色体异常有关。
母亲患有严重的内科疾病，或母亲免疫系统方面有异常，如红斑狼疮或母亲有硬皮病等，也会导致免疫异常从而导致胚胎停育。
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