肛瘘常表现肛周反复感染，复发率可达到60%以上。肛门周围脓肿，主要因污染粪便滞留肛隐窝，引起肛腺炎，导致肛门周围脓肿，是肛瘘形成的主要原因。
直肠肛门损伤，外伤来自消化道的骨性异物、金属、肛表及肛门损伤，细菌侵入伤口可引起肛门周围脓肿。
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