肠炎的治疗主要有病原治疗和对症治疗两种。对于细菌、真菌性的肠炎，可以选用抗生素治疗，一般病毒性的肠炎不需要病原治疗即可治好。
对症治疗主要就是纠正水电解质紊乱和酸中毒状态。轻度脱水者可口服补液，严重脱水者则需要静脉注射生理盐水。
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