阴茎上长疙瘩，这怎么了？

由于没有看到具体情况，无法给与明确的诊断，根据你的描述，不排除有生殖器疱疹，尖锐湿疣，皮肤疣以及珍珠样丘疹的可能。

生殖器疱疹是由疱疹性病毒感染引起的。尖锐湿疣是由人乳头瘤状病毒感染引起的。这两个都是通过性传播。而皮肤疣会好一些。

建议你去当地医院泌尿外科看一下。必要的时候可以先取病理检查。