附睾囊肿和附睾结核的区别是非常大的，直观的区别是病原体感染的不同，如果是附睾囊肿的话，应该是由局部细菌感染所引起的，比较常见的如金黄色葡萄球菌。
而附睾结核是由于结核杆菌感染所引起的疾病，两者的预后是截然不同的，并且在治疗上，结合需要规范的治疗。
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