检查出来HPV阳性：A9亚型：16。

你好！HPV阳性完全可以怀孕，药物治疗期间（全身用药）最好不能怀孕，怀孕期间，适当局部外用药，一般怀孕早期前三个月不建议使用药物，后三个月也不要使用药物，以免损伤胎儿。

此病一般全身中药及干扰素，局部激光及干扰素治疗，效果很好，能够痊愈。同时夫妻俩检查处理。祝早日康复！