能够引起胚胎停育的原因有很多，包括胚胎染色体异常、夫妇染色体异常、子宫发育不良、感染等因素都会导致胎儿停育。子宫里的内环境和子宫整体的环境都有可能对胚胎有影响。
母胎间的免疫不适应也可能引起母体对胎儿的排斥，母体自身内源性激素不足，也有可能造成胚胎的停育。
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