你好，巧克力囊肿是由于子宫内膜异位在卵巢，月经期脱落出血，出血在卵巢流不出来去的，如果大影响卵巢功能是可能影响怀孕。
建议巧克力囊肿需要结合囊肿大小，自己的排卵检测，月经史，激素检查等判断是否影响怀孕。
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