爸爸基因是46，X，Y，宝宝的,46，X，inv

问题分析：正常的情况下，宝宝会完全继承爸爸的Y基因，但也有可能爸爸的Y基因精子变异，Y染色体的片段发生倒位，那么宝宝继承的爸爸的Y基因就是变异后的Y基因。

人类Y染色体异染色质区倒位(inv(Y)的发生率依种族而有差异性，且因其携带者之外表多无异常，一直被视为染色体的正常多型性。

就是说，一般情况下不产生畸形。但可能与以后的一些慢性病有关。您的孩子将来的后代是女孩就不会继承他的Y基因变异啦。

意见建议：本人认为可以正常孕育，诞生婴儿。现在社会上也有很多46，X，inv(Y(P11，Q11)变异的正常人呢。

不过，您先生自己的基因是正常的，也许只有这一胎发生了变异。