支原体感染最对症的药物是大环内酯类药物，比如红霉素类，但是大环内酯类有可能长时间使用的话会有肾损伤，所以小儿使用期间注意监测肝肾功能等情况。
一般支原体感染治疗要比普通细菌或者病毒感染治疗困难，所以疗程相对比较长，需要彻底治愈后再停药，避免受凉加重病情。
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