霉菌肠胃炎可以应用一些调节肠道菌群的益生菌。出现霉菌性肠胃炎，多数与之前应用抗生素，或者长时间应用抗生素有关。应停用抗生素。
如果腹泻比较严重的话，可以加服收敛药物。还要注意饮食清洁清淡，配合治疗。
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