肾结核的病原菌主要来自结核，也来自骨关节结核、肠结核等器官。血行播散是肾结核的主要感染方式。结核分枝杆菌通过血流侵入肾脏。
当肾脏具有一定的敏感性，结核病灶首先在肾脏外皮层的肾小球毛细血管丛中形成。
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