毛囊炎主要由细菌感染、真菌感染等引起，如痤疮、普通毛囊炎等均为由细菌感染引起的毛囊炎症。也有伴随的因素，如石油分泌和孔堵塞。
真菌感染的主要原因是糠疹孢子菌毛囊炎，与普通毛囊炎基本一致，需要真菌显微镜来鉴别诊断的。
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