根据你提供的情况，怀孕3个多月的话，是可以做亲子鉴定的。指导意见可以通过穿刺的方法抽取羊水进行鉴定，该办法最好是在孕1424周之间进行。
在一些有授权的大型三甲医院或者司法鉴定研究所可以做该项检查，详情建议到当地的医院咨询。
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