首先需要化验梅毒、艾滋病、乙肝五项，丙肝。做胃镜检查前需要空腹，然后咽部喷局麻药，过10-20分钟后，从鼻孔或口腔插入胃镜，边进镜，边观察。
必要时，可以取活检。做肠镜首先需要清洁洗肠，然后，从肛门插入肠镜，边进镜边观察。最后，肠镜可以插入到回盲部。
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