一开始咳嗽，腰部右侧软肉一咳嗽就痛

根据你的描述，出现腹部肌肉发生疼痛，多是由于剧烈咳嗽等原因继发引起。需要及时针对病因治疗。建议去医院的呼吸科进行诊疗，明确疾病后使用抗生素、镇咳药物等进行治疗。

如果咳嗽痊愈后经一段时间腰部不适还有。可去医院的外科进行诊疗。如果腰部不适明显缓解或痊愈，可不用再去诊疗。