昨天去补牙医生给我磨牙后放上棉花，棉花上的药很刺激，医生说主要是防止饭渣进去，叫我两天后复诊

根据你的描述医生给你采取的是根管治疗，医生的现在的步骤是封失活剂，此类药物有快失活和慢失活两类，快失活隔日复诊，慢失活剂一般需要封药1周时间，封药的过程中会逐渐杀死牙髓，下次拔除牙髓后就会没有疼痛。

建议消除紧张，建议遵循医嘱，下一步是拔除牙髓，根管预备，根管消毒，最好根管充填的过程。如果牙齿缺损较大，可考虑桩核冠或者烤瓷冠修复。