唇腭裂是属于先天性发育畸形，与妊娠早期营养缺乏有一定的关系，也与母体在妊娠初期遭受损伤，特别是能够引起子宫及其邻近部位的损伤，如不全流产或不科学的坠胎有关。
使用某些特殊药物，比如激素，抗肿瘤药物，抗惊厥的药物，抗组胺药物均可以导致胎儿畸形。
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