宝宝阴茎上有黑疙瘩怎么处理呢？

根据你所描述的情况，生殖器疱疹的可能性较大，建议到医院男科就诊。对于生殖器疱疹，当出现局部的感染后，要及时用消毒水清洗局部。

常用3%硼酸水外洗患部，也可用黄连素1片研末加入沸开水中，待凉后清洗患部。其次，避免局部的搔抓，不可用刺激性太强的药品。

大概需要一个月左右的时间。