阴茎体上为什么会有小水泡？是什么原因？

据你所述考虑有生殖器疱疹可能，是由病毒感染引起的，可通过性交传播，病变主要发生于包皮、龟头、冠状沟等部位，主要表现为成簇的水疱与脓疱，破溃后可有疼痛感，可自愈但易复发。

单凭叙述不能确诊，也不排除其他疾病的可能。要确诊的话最好去正规医院，自己对照症状表现的话，很容易出现错误，同时，如果症状不典型，是需要实验室的检查来确诊的，这个必须到医院检查。