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原核基因组中除rRNA、tRNA基因有多个拷贝外，重复序列不多。哺乳动物基因组中则存在大量重复序列(repetitivesequences。

用复性动力学等实验表明有三类重复序列：①高度重复序列(highlyrepetitivesequences，这类序列一般较短，长10300bp，在哺乳类基因组中重复106次左右，占基因组DNA序列总量的1060#xFF05;，人的基因组中这类序列约占20#xFF05;，功能还不明了。

②中度重复序列(moderatelyrepetitivesequences，这类序列多数长100500bp，重复101105次，占基因组1040#xFF05;。

例如哺乳类中含量最多的一种称为Alu的序列，长约300bp，在哺乳类不同种属间相似，在基因组中重复3×105次，在人的基因组中约占7#xFF05;，功能也还不很清楚。

在人的基因组中18S/28SrRNA基因重复280次，5SrRNA基因重复2000次，tRNA基因重复1300次，5种组蛋白的基因串连成簇重复3040次，这些基因都可归入中度重复序列范围