早孕40时做B超，显示有胎芽，胎心。但有不均质回声

需要确切的检查一下不均质的回声位于什么位置，如果是子宫壁上的，有增大，要注意是否影响继续妊娠。如果是腹腔内的，怀孕以后明显快速的增大，可能是卵巢肿瘤。

您目前的描述应和之前流产无关，可以把您具体的这两次B超检查结果描述一下。如果是在子宫腔内孕囊内或胚胎周围的，再考虑是和胚胎本身发育有关。