我怀孕快两个月了，发现右侧卵巢

问题分析：你好，卵巢有一个比较大的囊肿，但是如果怀孕前没有检查有囊肿，怀孕后可能是生理性的如黄体囊肿，但是也不能排除卵巢病变。

意见建议：建议你小便疼痛跟囊肿关系不大，需要检查是否有泌尿系感染，如果是腹痛可能是囊肿压迫，怀孕两个月也不能手术，继续观察到三个月半月看看。