引起子宫发育不良的病因有：卵巢发育异常，常见于卵巢发育不全，卵巢不能分泌激素刺激子宫发育。下丘脑/垂体功能异常导致卵巢不能排卵，无法分泌激素刺激子宫发育，故而形成子宫偏小。
严重的贫血或某些代谢性疾病，比如甲状腺功能异常也会引起女性幼稚子宫。
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