发烧后太阳穴一阵一阵的疼是什么原因呢

发烧太阳穴一阵一阵的疼痛，中医讲主要是少阳头痛，少阳经循行于头面部，中医讲气血经络不通则痛，受风寒等引起经络不畅，少阳为阳经，头为诸阳之会，风寒之邪侵袭所以引起正邪相争的少阳头痛。

建议你找中医内科大夫看看，根据你的情况辩证施治，开些中药。也可以先喝柴胡口服液试试。