患有肺孢子菌肺炎的很大一部分都携带艾滋病病毒，因此建议到正规医院的感染科抽血化验，查人免疫缺陷病毒的抗体，如果抗体为阴性才可以排除艾滋病，只进行肺孢子菌肺炎的治疗，如果抗体为阳性，则需要抗病毒。
采用抗真菌等内服药物或碘化钾等外用药物治疗。
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