先天性肝囊肿绝大部分都不需要处理，只需要定期观察。一部分生长较快、囊肿较大、伴发感染、出现症状者需要处理。先天性肝脏囊肿目前还没有预防办法。
也不能通过药物治疗和预防。重要的是定期体检与复查，所以出生后可能是需要考虑手术的，也可以定期观察
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