近亲结婚所产生的后代造成先天性缺陷的机率极大，但不是完全的，也有的隔几代才会出现。从遗传学上来讲，每个人身上都会带有很多有害的隐性的等位基因。
近亲结婚会使这种隐性的等位基因有很多相遇的机会，会引起遗传上的异常，有的会出现痴呆、遗传疾病、畸形儿等。
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