肠道菌群失调是肠道菌群的组成发生了改变，主要是细菌活性或菌群分布变化引起的一种失衡状态。肠道菌群失调症状和病情严重程度息息相关。
1.一度菌群失衡，临床症状不明显，可能会有大便不通畅或者大便次数增加，伴有口臭、食欲不振、消化不良等症状。
2.二度菌群失衡，此时会出现腹痛、腹泻、腹胀等症状，也会伴有肠鸣音亢进、发热、恶心、呕吐等症状。需要使用肠道益生菌类药物进行治疗，如枯草杆菌二联活菌颗粒、乳酸菌素片等。
3.三度失衡，也称菌群交替症，和长期大量使用抗生素、免疫抑制剂、糖皮质激素类药物等相关，肠道内大部分正常菌群被抑制，少数条件致病菌过度生长繁殖，可能会出现真菌感染、假膜性肠炎，腹泻、腹痛症状比较严重的患者，会出现水和电解质紊乱。
