与其他疱疹病毒一样,HHV6病毒颗粒呈球形,有包膜,平均直径约为150纳米(nm。基因组为线状双链DNA。其核衣壳与包膜之间为基质蛋白组成的皮层(TEGUMENT)。
包膜表面有由病毒编码的糖蛋白组成的刺突。
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