大部分泌尿系统结石原因不明,代谢性结石最为多见,是由于体内或肾泌尿系结石内代谢紊乱而引起,如甲状腺功能亢进、特发性尿钙症引起尿钙增高、肾小管酸中毒时磷酸盐大量增加等。
此外结石的形成与种族、遗传、性别、年龄、地理环境、饮食习惯、营养状况等均有关系。
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